Ubehlo odvtedy desať rokov. Nadšenie mladých aktivistov z pádu autoritatívneho režimu a z nádeje na lepšiu budúcnosť vystriedal boj o moc medzi islamistami a armádou. Vyvrcholilo to masakrom z leta 2013, keď armáda zvrhla prezidenta Muhammáda Mursího a zabila približne osemsto jeho prívržencov. Moc prebral veliteľ armády Abdal Fattáh Sísí, ktorý sa o rok neskôr stal prezidentom a zaviedol režim, ktorý v brutálnosti veľmi skoro prekonal ten Mubarakov. Baghat o ňom písal investigatívne články, upozorňoval na korupciu v radoch všemocnej armády, za čo si vyslúžil zákaz vycestovania a zmrazenie účtu. Úrady ho obviňovali, že ho financujú zo zahraničia.