விசை ஆய்வகம் ஆஃப் உயிரி எரிபொருள்கள் News Today : Breaking News, Live Updates & Top Stories | Vimarsana

Stay updated with breaking news from விசை ஆய்வகம் ஆஃப் உயிரி எரிபொருள்கள். Get real-time updates on events, politics, business, and more. Visit us for reliable news and exclusive interviews.

Top News In விசை ஆய்வகம் ஆஃப் உயிரி எரிபொருள்கள் Today - Breaking & Trending Today

Research team designs novel Microbiome Search Engine 2

Research team designs novel Microbiome Search Engine 2
When it comes to large-scale mining of microbiome data sets, the process can be complicated, tedious, and downright overwhelming. Given the large volume of data, it is difficult to relate a new microbiome sample to the huge number of existing microbiome samples.
To help streamline the process of correlating newly developed microbiomes with existing data sets, a research team has introduced Microbiome Search Engine 2 (MSE 2), a microbiome database platform for searching query microbiomes against the existing microbiome data sets on the basis of their similarity in taxonomic structure or functional profile. The authors note key improvements such as database extension, data compatibility, a search engine kernel, and a user interface. ....

United States , Liu Lu , Jing Gongchao , American Society For Microbiology , Key Laboratory Of Biofuels , Bioprocess Technology , Ncell Center , Qingdao Institute Of Bioenergy , Chinese Academy Of Sciences , Microbiome Search Engine , American Society , Single Cell Center , Qingdao Institute , Chinese Academy , Nutraingredients United States , ஒன்றுபட்டது மாநிலங்களில் , லியூ லு , அமெரிக்கன் சமூகம் க்கு நுண்ணுயிரியல் , விசை ஆய்வகம் ஆஃப் உயிரி எரிபொருள்கள் , செல் மையம் , சீன கலைக்கழகம் ஆஃப் அறிவியல் , அமெரிக்கன் சமூகம் , ஒற்றை செல் மையம் , சீன கலைக்கழகம் ,

Microbiome Search Engine 2 helps researchers explore microbiome space

Credit: JING Gongchao
Metagenomics - the study of genetic material from an environmental sample - is growing as species evolve or are discovered across the globe. To correlate the newly developed microbiomes with existing data sets, a team of researchers based in China has developed the Microbiome Search Engine 2 (MSE 2). It was published on Jan. 19 in
mSystems, a journal of the American Society for Microbiology.
Here, we introduce MSE 2, a microbiome database platform for searching query microbiomes in the global metagenome data space based on taxonomic or functional similarity of the whole microbiome, said co-first author JING Gongchao, Single-Cell Center, CAS Key Laboratory of Biofuels, Qingdao Institute of BioEnergy and Bioprocess Technology (QIBEBT), Chinese Academy of Sciences (CAS). ....

United States , American Society For Microbiology , Key Laboratory Of Biofuels , Bioprocess Technology , Ncell Center , College Of Computer Science , Chinese Academy Of Sciences , Natural Science Foundation Of China , Qingdao University , Qingdao Institute Of Bioenergy , Shandong Natural Science Foundation , Microbiome Search Engine , American Society , Single Cell Center , Qingdao Institute , Chinese Academy , Computer Science , Natural Science Foundation , ஒன்றுபட்டது மாநிலங்களில் , அமெரிக்கன் சமூகம் க்கு நுண்ணுயிரியல் , விசை ஆய்வகம் ஆஃப் உயிரி எரிபொருள்கள் , செல் மையம் , கல்லூரி ஆஃப் கணினி அறிவியல் , சீன கலைக்கழகம் ஆஃப் அறிவியல் , இயற்கை அறிவியல் அடித்தளம் ஆஃப் சீனா , சாண்டோங் இயற்கை அறிவியல் அடித்தளம் ,

Meta-Apo supports cheaper, quicker microbiome functional assessment

Credit: JING Gongchao
A new algorithm may reduce the need for expensive, time-consuming whole-genome sequencing computations to understand how a microbiome functions. A team led by JING Gongchao of the Qingdao Institute of BioEnergy and Bioprocess Technology (QIBEBT) of the Chinese Academy of Sciences (CAS) and SU Xiaoquan of Qingdao University, published their approach, called Meta-Apo, on Jan. 6 in
BMC Genomics.
Researchers routinely sequence samples of microbial communities found on human skin, in human guts, and in the environment to understand what genes they contain with the ultimate goal of understanding how they function.
According to JING, the first author of the study, two main approaches exist: shotgun whole-genome sequencing and 16S rRNA gene amplicons. Whole-genome sequencing requires significant sequencing cost as well as computing power to determine all of the genes and their functions in a single sample, while 16S rRNA gene amplicons can quickly ....

Key Laboratory Of Biofuels , College Of Control Science , China Postdoctoral Science Foundation , China University Of Petroleum , Bioprocess Technology , Ncell Center , Shandong Provincial Natural Science Foundation , College Of Computer Science , Chinese Academy Of Sciences , Natural Science Foundation Of China , Qingdao University , Qingdao Institute Of Bioenergy , Qingdao Institute , Chinese Academy , Single Cell Center , Control Science , China University , Computer Science , Natural Science Foundation , விசை ஆய்வகம் ஆஃப் உயிரி எரிபொருள்கள் , கல்லூரி ஆஃப் கட்டுப்பாடு அறிவியல் , சீனா போஸ்ட்‌டாக்டொரல் அறிவியல் அடித்தளம் , சீனா பல்கலைக்கழகம் ஆஃப் பெட்ரோலியம் , செல் மையம் , சாண்டோங் மாகாண இயற்கை அறிவியல் அடித்தளம் , கல்லூரி ஆஃப் கணினி அறிவியல் ,