DBT-NIBMG creates world's first database of genomic variants of oral cancer – India Education | Latest Education News | Global Educational News

Jul 8, 2021
dbGENVOC is a  browsable  online database of GENomic Variants of Oral Cancer and is a free resource. First release of dbGENVOC contains (i) ~24 million somatic and germline variants derived from whole exome sequences of 100 Indian oral cancer patients and whole genome sequences of 5 oral cancer patients from India, (ii) somatic variation data from 220 patient samples drawn from the USA and analyzed by TCGA-HNSCC project and (iii) manually curated variation data of 118 patients from recently published peer-reviewed publications. Variants were identified by the community approved best practice protocol and annotated using multiple analytic pipeline.
dbGENVOC is not just a catalogue of genomic variants, it has a built-in powerful search engine. It also allows a reasonable extent of statistical and bioinformatic analysis to be carried out online, including identifying variants in associated altered pathways in oral cancer.

Related Keywords

Kolkata ,West Bengal ,India ,Kalyani ,Karnataka ,United States ,New Delhi ,Delhi , ,Institute Of Biomedical Genomics ,National Institute Of Biomedical Genomics ,Kalyani An Autonomous Institute ,Department Of Biotechnology ,Ministry Of Science ,National Institute ,Biomedical Genomics ,Autonomous Institute ,Oral Cancer ,கொல்கத்தா ,மேற்கு பெங்கல் ,இந்தியா ,கல்யாணி ,கர்நாடகா ,ஒன்றுபட்டது மாநிலங்களில் ,புதியது டெல்ஹி ,டெல்ஹி ,நிறுவனம் ஆஃப் உயிர் மருத்துவ மரபியல் ,தேசிய நிறுவனம் ஆஃப் உயிர் மருத்துவ மரபியல் ,துறை ஆஃப் உயிரி தொழில்நுட்பவியல் ,அமைச்சகம் ஆஃப் அறிவியல் ,தேசிய நிறுவனம் ,உயிர் மருத்துவ மரபியல் ,தன்னாட்சி நிறுவனம் ,வாய்வழி புற்றுநோய் ,