DBT-NIBMG creates world's first database of genomic variants

Jul 8, 2021
dbGENVOC is a  browsable  online database of GENomic Variants of Oral Cancer and is a free resource. First release of dbGENVOC contains (i) ~24 million somatic and germline variants derived from whole exome sequences of 100 Indian oral cancer patients and whole genome sequences of 5 oral cancer patients from India, (ii) somatic variation data from 220 patient samples drawn from the USA and analyzed by TCGA-HNSCC project and (iii) manually curated variation data of 118 patients from recently published peer-reviewed publications. Variants were identified by the community approved best practice protocol and annotated using multiple analytic pipeline.
dbGENVOC is not just a catalogue of genomic variants, it has a built-in powerful search engine. It also allows a reasonable extent of statistical and bioinformatic analysis to be carried out online, including identifying variants in associated altered pathways in oral cancer.

Related Keywords

Kolkata , West Bengal , India , Kalyani , Karnataka , United States , New Delhi , Delhi , , Institute Of Biomedical Genomics , National Institute Of Biomedical Genomics , Kalyani An Autonomous Institute , Department Of Biotechnology , Ministry Of Science , National Institute , Biomedical Genomics , Autonomous Institute , Oral Cancer , கொல்கத்தா , மேற்கு பெங்கல் , இந்தியா , கல்யாணி , கர்நாடகா , ஒன்றுபட்டது மாநிலங்களில் , புதியது டெல்ஹி , டெல்ஹி , நிறுவனம் ஆஃப் உயிர் மருத்துவ மரபியல் , தேசிய நிறுவனம் ஆஃப் உயிர் மருத்துவ மரபியல் , துறை ஆஃப் உயிரி தொழில்நுட்பவியல் , அமைச்சகம் ஆஃப் அறிவியல் , தேசிய நிறுவனம் , உயிர் மருத்துவ மரபியல் , தன்னாட்சி நிறுவனம் , வாய்வழி புற்றுநோய் ,