Lessons from applied large-scale pooling of 133,816 SARS-CoV

Lessons from applied large-scale pooling of 133,816 SARS-CoV-2 RT-PCR tests


Batch testing for SARS-CoV-2
Frequent and accurate RT-PCR–based testing is essential for preventing and managing SARS-CoV-2 infection; however, active infection surveillance is still often limited by time or resources. Cleary
et al. demonstrate that considering population-level viral prevalence and individual viral loads allows for efficiency gains upon pooled testing with minimal loss of sensitivity, both theoretically and as validated in vitro using human swab and sputum samples. Barak
et al. show that pooled testing of 133,816 hospital-collected patient nasopharyngeal samples eliminated three quarters of testing reactions with only a minor reduction in sensitivity, demonstrating the efficacy of the approach in the field. Both studies suggest that considered pooling of individual samples before testing could reliably increase SARS-CoV-2 testing throughput.

Related Keywords

Hebrew University , Yerushalayim , Israel , Jerusalem , Israel General , Arbel , Ha Afon , Yutti Daitch , Irit Fogel , Gil Benedek , Danag Wolf , Roni Ben , T Miriam Rohrlich , Esther Oiknine Djian , Ayalah Livneh , E Chabube Kripper , Adi Sabatani , D Ben Zvi , Mila Rivkin , Hadassah Medical Center , Drug Administration , World Health Organization , Instrument Applied Biosystems Inc , Edmond De Rothschild Foundation Israel , Hebrew University Of Jerusalem , Laboratory Information System , Hadassah Medical Center Institutional Review Board , Emergency Use Authorizations , Hebrew University Hadassah , Pathogen Mini Kit , Applied Biosystems Inc , Tecan Freedom Evo , Creative Commons Attribution , Edmond De Rothschild Foundation , Hebrew University Faculty , Medicine Computational , Azrieli Faculty , Roni Ben Ami , Tal Sido , ஹீப்ரு பல்கலைக்கழகம் , இஸ்ரேல் , ஏருசலேம் , இஸ்ரேல் ஜநரல் , ரோனி பென் , ஹடாஸா மருத்துவ மையம் , உலகம் ஆரோக்கியம் ஆர்கநைஸேஶந் , எட்மண்ட் டி ரோத்ஸ்‌சைல்ட் அடித்தளம் இஸ்ரேல் , ஹீப்ரு பல்கலைக்கழகம் ஆஃப் ஏருசலேம் , ஆய்வகம் தகவல் அமைப்பு , ஹீப்ரு பல்கலைக்கழகம் ஹடாஸா , பயன்படுத்தப்பட்டது உயிர் அமைப்புகள் இன்க் , எட்மண்ட் டி ரோத்ஸ்‌சைல்ட் அடித்தளம் , ஹீப்ரு பல்கலைக்கழகம் ஆசிரிய , ரோனி பென் அமி ,

© 2025 Vimarsana