New tools enable rapid analysis of coronavirus sequences and tracking of variants

 E-Mail
IMAGE: In this example of UShER results, displayed using Nextstrain, sequences representing a hypothetical outbreak are yellow, previously sampled sequences are blue, and branches are labeled by nucleotide mutations.
view more 
Credit: UC Santa Cruz Genomics Institute
The COVID-19 pandemic has spurred genomic surveillance of viruses on an unprecedented scale, as scientists around the world use genome sequencing to track the spread of new variants of the SARS-CoV-2 virus. The rapid accumulation of viral genome sequences presents new opportunities for tracing global and local transmission dynamics, but analyzing so much genomic data is challenging.
"There are now more than a million genome sequences for SARS-CoV-2. No one had anticipated that number when we started sequencing this virus," said Russ Corbett-Detig, assistant professor of biomolecular engineering at UC Santa Cruz.

Related Keywords

United States ,India ,Canberra ,Australian Capital Territory ,Australia ,Angie Hinrichs ,Yatish Turakhia ,Russ Corbett Detig ,David Haussler ,Landen Gozashti ,Bryan Thornlow ,European Bioinformatics Institute ,Alfredp Sloan Foundation ,Genomics Institute ,National Institutes Of Health ,Uc Santa Cruz Genomics Institute ,Robert Lanfear At Australian National University ,Cruz Genomics Institute ,Ultrafast Sample Placement ,Existing Trees ,Epidemiology Toolkit ,Nicola De Maio ,Robert Lanfear ,Australian National University ,National Institutes ,ஒன்றுபட்டது மாநிலங்களில் ,இந்தியா ,கான்பெரா ,ஆஸ்திரேலிய மூலதனம் பிரதேசம் ,ஆஸ்திரேலியா ,ஆங்கி ஹின்ரிச் ,யத்திஷ் துராகியா ,ஐரோப்பிய உயிர் தகவலியல் நிறுவனம் ,மரபியல் நிறுவனம் ,தேசிய நிறுவனங்கள் ஆஃப் ஆரோக்கியம் ,அக் சாந்தா குரூஸ் மரபியல் நிறுவனம் ,குரூஸ் மரபியல் நிறுவனம் ,இருக்கும் மரங்கள் ,ஆஸ்திரேலிய தேசிய பல்கலைக்கழகம் ,தேசிய நிறுவனங்கள் ,